Одна из возможных причин ошибки подписания ЭП в системе это отсутствие сертификата Минцифры России в доверенных корневых центрах сертификации в ОС Виндовс.
Чтобы его туда добавить необходимо выполнить инструкцию:
Найдите Ваш сертификат подписи в хранилище сертификатов. Пуск → Сертификаты 
.
В открывшемся окне перейти в Сертификаты → Личное → Реестр → Сертификаты и найти актуальный сертификат и открыть его.
Перейти во вкладку "Путь сертификации" и найти сертификат Минцифры России.
Выберите его и нажмите "Просмотр сертификата".
Установите его в доверенные корневые центры сертификации
В новом открывшемся окне нажмите Далее.
Выберите опцию "Поместить все сертификаты в следующее хранилище" и выберите "Доверенные корневые центры сертификации".
Нажмите Готово и в появившемся окне Ок.
Вопросы по теме знания, а так же не корректности данных можно задать на портале техподдержки https://my-sp.ru/